矿床的工业类型有两大类。一类是矽卡岩矿床，钼的原矿品位较高(>0.2%)，辉钼矿嵌布粒度粗、易选，如栾川钼矿。另一类为细脉浸染型钼矿床，又称斑岩型钼矿床，钼的原矿品位较低（0.1%左右)，嵌布粒度细，较前类难选。这两类矿床钼含量占总量的80%以上。

常见的钼矿石包括单一钼矿石、铜钼矿石、钨钼矿石、碳质铜钼矿石、钒铀钼矿石等。钼矿物有辉钼矿（MoS2）、彩钼铅矿（PbMoO4）钼钙矿（CaMoO4）、钼铁矿（Fe2(MoO4)3.7H2O）、钼华MoO3、钼铀矿（UO3.2MoO3.4H2O）等。

自然界已知的钼矿物有20多种、其中储量最大、工业价值最高的是辉钼矿，而且常含有铼。金堆城钼矿床属于斑岩型钼矿床，其钼矿石主要为单一钼矿石，钼矿物主要为辉钼矿。

辉钼矿的选矿方法主要是浮选法，它是利用各种矿物表面物理化学性质上的差异，把矿石原料中的一种或一组矿物，有选择性地富集在两相界面的过程。未氧化的辉钼矿只用起泡剂就能浮起，浮选时主要是加入非极性油类捕收剂，如煤油或变压器油等。但是由于辉钼矿都不同程度地受到氧化，其可浮性有所降低，故浮选时有时也加黄药。淀粉、糊精、动物胶、皂素等对辉钼矿有抑制作用。

辉钼矿常与钨酸钙矿、黄铁矿、黄铜矿、钨锰铁矿、辉铋矿等共生。在浮选辉钼矿时，常用硫化钠或诺克斯药剂等抑制伴生的金属硫化矿物。

由于后续加工对钼精矿质量要求高，因此处理单一钼矿石常采用粗精矿再磨再选，阶段磨矿阶段浮选，多次精选（常达6-8次）流程。国内外生产实践表明，放粗第一段磨矿细度，增加再磨次数，是提高钼精矿质量的有效措施。